工程审计是指审计机构依据国家的法令和财务制度、企业的经营方针、管理标准和规章制度，对工程项目的工作，用科学的方法和程序进行审核检查，判断其是否合法、合理和有效，以及发现错误、纠正弊端、防止舞弊、改善管理，保证工程项目目标顺利实现的活动。工程审计独立于项目组织之外，审计人员与项目组织无任何直接的行政或经济关系。
工程审计包括两大类型：工程造价审计和竣工财务决算审计
造价审计一般是对单项、单位工程的造价进行审核，其审计过程与乙方的决算编制过程基本相同，即按照工程量套定额。这由造价工程师完成。
对于建设单位来说，由于造价审计只是审核单项、单位工程的合同造价，一个建设项目的总的支出是由很多单项、单位工程组成的，而且还有很多支出比如前期开发费用、工程管理杂费等是不需要造价审计的，所以还要有一个竣工财务决算审计，就是将造价工程师审定的，和未经造价工程师审核的所有支出加在一起，审查其是否有不合理支出，是否有挤占建设成本和计划外建设项目的现象等，来确定一个建设项目的总的造价。这由注册会计师完成。
分析法。
它是指审计人员运用各种系统方法，对基建工程项目的具体内容进行分离和分类，然后综合分析，发现疑点，揭露问题的方法。分析法的目的在于：
（1）通过分析查找可疑事项，为审计工作寻找线索，进而查出各种错误和弊端；
（2）通过分析来验证各种资料（如施工合同、施工图纸、隐蔽工程签证等资料）所反映的基建工程项目的真实情况，进而核实实际工程量与审定工程造价。如对某单位一建筑项目进行审计，通过利用分析法发现该项目土方工程量是该项目建筑面积的28倍（即该建筑展开面积需要大开挖28米），对此找建筑单位与施工单位有关人员了解情况，并将隐蔽工程签证与施工日记相查对，核减土方工程量4500立方米，核减工程造价13.7万元。
核对法。
指在基建工程决算审计中用一种记录或资料同另一种记录或资料进行查对，用相互验证和复核的手段，验证基建工程决算工程量与造价真实性、合理性的一种审计技术方法。如2002年我们对某单位一基建项目进行审计，利用被审计单位所提供的隐蔽工程签证单与施工单位所提供的施工日志相核对，查出该基建工程决算重复签证与乱签证、多计隐蔽工程造价。