根据《办公厅关于清理规范工程建设领域保证金的通知》的要求：一、清理各类保证金。对建筑业企业在工程建设中需缴纳的保证金，除依法依规设立的投标保证金、履约保证金、工程质量保证金、农民工工资保证金外，其他保证金一律取消。对取消的保证金，自本通知印发之日起，一律停止收取。二、转变保证金缴纳方式。对保留的投标保证金、履约保证金、工程质量保证金、农民工工资保证金，推行银行保函制度，建筑业企业可以银行保函方式缴纳。
投标保函作为替代保证金的理想方式，节约了大量的投标人的资金占用问题，受到投标人的欢迎；而且投标保函是国家极力推荐的一种方式，所以投标保函近几年在国内的应用非常广泛。
通过担保公司办理银行保函的流程是：
1、电话或在线咨询担保公司
2、提供营业执照和招标文件
3、担保公司人员确认保函格式和开盘时间以及费用
4、出函并提供保函扫描件
5、快递原件
投标保函的办理一般较为快捷、简单，是较为理想的银行保函办理方式
预付款保函与履约保函的区别：
履约保函是为了保证中标单位如约履行工程合同的内容
预付款保函是保证在甲方支付了预付款之后能收到合同约定的效果，也即在甲方支付了预付款之后如乙方没有履行合同，银行则将预付款保函的相应押金交还给甲方作为损失补偿。
也就是说这是两个不同的保函，都是要交的。因此从某一个角度也能体现施工单位的经济实力。
不过不用担心，作为预付款的保函既然是为了保证预付款的，就不像履约保函那样一定要到工程全部建设结束，合同内容履行完毕之后才退还给你。通常是约定保证预付款用在合同上就可以退还了。只是在工程建设前期冻结在银行，后面就解冻了。