资金来源不同。履约保证金一般来自承包方的流动资金，在施工前付给发包方。质量保证金是发包方与承包方在建设工程承包合同中约定或承包方在工程保修书中承诺，在工程竣工验收交付使用后，从应付的建设工程款中预留的用以维修工程在保修期限和保修范围内出现的质量缺陷的资金。
约束的目的不同。履约保证金的目的是担保承包人完全履行合同，主要保证工期和质量符合合同的约定。履约保证金的功能，在于承包人违约时，赔偿发包人的损失，也即如果承包人违约，将丧失收回履约保证金的权利，且，并不以此为限。质量保证金则更多的是一种约束工程质量的手段。
1、申请人填写《保函申请书》并提交有关资料；
2、银行对申请人的资格、申请手续和项目可行性进行审查；
3、签定协议，落实保证金或反担保；
4、银行为申请人开立投标保函。
* 投标保函办理的金额一般为投标报价的1%—5%。
* 投标保函的期限
投标保函有效期一般为六个月以内，从开出之日起生效。
履约保函申请条件
1、在申请银行开户；
2、具备履行担保项下合约的能力；
3、项目符合国家规定；
4、提供符合要求的保证金或反担保。