氨基酸的种类和含量
燕窝中的氨基酸种类丰富，富含苯丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、酪氨酸和精氨酸等。燕窝中的水解氨基酸含量达42.272%，且必需氨基酸含量占氨基酸总量的42%；同时，呈鲜味特征的氨基酸（天门冬氨酸和谷氨酸）和呈芳香味特征的氨基酸（酪氨酸和苯丙氨酸）含量较高，表明燕窝的味道鲜美。食物营养价值的优劣主要取决于所含氨基酸的种类、数量和比例。联合国粮农组织和世界卫生组织提出了食品中必需氨基酸参考模式谱，规定了人体必需氨基酸占总氨基酸的质量比以及必需氨基酸与非必需氨基酸的质量比分别为40%和60%。
蛋白质
燕窝中的蛋白质含量较高，但与其品种关系紧密。试验选用的马来西亚金丝燕燕窝，其含量达50.26%。
唾液酸
唾液酸又称燕窝酸，是燕窝主要的生物活性成分，在燕窝中主要以N-乙酰神经氨酸形式存在。据报道，一般燕窝的唾液酸含量可达7%以上，这也是初步鉴定真假燕窝的手段。
洞燕是采摘于野外山洞、沿海峭壁的燕窝，这是原始的燕窝的存在形态。洞燕色灰色或黄色，羽毛及杂质较多，口感较为爽实。因早期的滥采，金丝燕生存环境遭到破坏，洞燕的产量逐年下降，洞燕出产量很低。随着环保呼声高涨，人们积极改变了金丝燕生存环境和燕窝采摘环境。随后，洞燕逐渐被屋燕取代。屋燕只是采摘的环境由山洞、峭壁变成了人工搭建、适合金丝燕筑巢的人工屋，而并没有改变金丝燕的生活习性。大自然的原始森林环境和人工屋技术的结合，有效解决了金丝燕保护和燕窝产量的矛盾，形成了独特的原生态屋燕，屋燕色较白，质松，毛少口感较滑软。如果燕子屋的卫生条件控制得好，屋燕窝会相对干净，色泽也较理想，而洞燕窝则可能会有较多的沙粒、泥土及其它物质。
体腔中有1个或两个中空的树枝状器官，后端会合于泄殖腔，称呼吸树或水肺，是海参的呼吸器官，靠泄殖腔的膨胀和收缩，水可以出入呼吸树而行呼吸作用。泄殖腔附近有许多细长的白色或淡红色的盲管，开口于呼吸树的基部，或者直接开口于泄殖腔，称居维氏器管，是海参的防御器官。但是并不是所有海参都有呼吸树和居维氏器官。
水管系统是棘皮动物特有的器官，其基本排列是：围绕食道有环水管，环具有石管和波里氏囊，并向各辐部分出5个辐水管，向前有分枝通至触手。辐水管有分枝通至管足，靠水的流入和流出，帮助海参运动。海参类的筛板多开口于体腔之内。